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Dopo l'unione dei settori giovanili nell'agosto 2005, le due società completano la fusione diventando ufficialmente un'unica società. Dall' U.S. Rettorgole e Caldogno 2000 nasce l' U.S.D. Caldogno Rettorgole. La squadra viene iscritta al campionato di Promozione, ereditando il titolo dall' U.S. Rettorgole.
A partire dalla stagione 2014-2015, viene cambiata la denominazione societaria: da USD Caldogno Rettorgole il nome diventa USD Calidonense.
La Prima Squadra, guidata da mister Rigo, disputa una grande stagione nella Coppa Italia di Promozione, arrivando sino alla finale.
Nella stagione 2017-2018 viene raggiunto sul campo il punto più alto nella storia, arrivando al terzo posto ottenuto ai play-off nel Campionato di Promozione in regione su 64 squadre
Per la prima volta nella storia la società raggiunge il campionato di Eccellenza, grazie al terzo posto conquistato nei play-off della stagione precedente.
